其轻罪，重其重罪的原则，事关典礼及风俗教化等事，定罪较轻；贼盗及关于钱粮等人民财产之事，定罪较重。
朱慈烺稍改了几条后，只对《大明律》的五刑、十恶、八议等三十卷四百六十条律法被细化完善。
形成了五刑、十恶、八议、吏律、民律、刑律、兵律、礼律、工律、商律、农律一百零八卷一千二百八十条律法。
新修订的《大明律》不仅涵盖了当下所有能够涉及到的律法条文，还在一些较难界定的条款之下进行了注解。
包括处理方案，给了更为实际的操作性，一些难办的案子在新的《大明律》面前都不再是问题。
一切有权力的人容易滥用权力，这是万古不变的经验，防止滥用权力的办法，就是以权力制约权力。
因此，法律细化是很有必要性的。
如果法律没有明确细致的加以规定，就会导致授权不明，执法者随意根据自己的需要来适用法律，根据“关系”的需要来适用法律。
如此带来的问题便是滋生腐败，甚至还导致司法人员、执法人员敲诈勒索、受贿索贿、贪脏枉法、徇私舞弊等方面犯罪严重，发案增多。
朱慈烺将这次司法改革进行的很彻底，修改律法，调整了司法机构、加强监察职能。
中央正式的司法机关是刑部、大理寺、都察院，合称“三法司”，各自的具体分工有所变化。
刑部，专司审判之职，分别受理地方上诉案件、审核地方徒刑以上重案，审理京师地区和中央百官的案件。
大理寺，掌复核，凡刑部所审案件，都须将案卷连同罪犯，移送大理寺复核。
都察院，原本大明的风宪衙门，什么屁事都能管，现在只负责监察文官，对官吏的违法失礼行为有权纠察弹劾。
朱慈烺考虑再三，最终还是给了都察院遇到重大案件可以参与三司会审的权利，三方总比两方来的稳定。
如果是皇帝亲自交代的案件，则还需要三法司会同东缉事厂审理。
至于“九卿会审”，则直接取消了，外行人还是少插手司法案件为妙。
九卿会审，更多的不是审案子，而是大臣之间党争的博弈，谁输谁倒霉。
（九卿会审，即遇有特别重大案件，由三法司会同吏、户、礼、兵、工部尚书及通政使共同审理，最后的判决须奏请皇帝审核批准。）
地方的司法机关分为省、府、县三级，府、县由法院处理狱讼事务，省级的依旧由提刑按察使司处置，因为这部门本来就是单独列出的。
提刑按察使有权处决一省徒刑以下案件，徒刑以上案件须报送中央刑部审核批准。
为了避免刑事案件频繁，使律法深入乡村，朱慈烺下旨各地官府，在各乡重建明初的“申明亭”，用以张贴榜