达了拔营撤军、速回登州的命令，而这时战败消息已经传开，叛军内部大乱，许多人见势不妙溜之大吉，不想再待在这艘即将沉沦的破船上
莱州城中，知府朱万年得知叛军大营异动，当即抓住这个机会，亲率上千兵马杀出，叛军竟无人敢当，崩溃四散，追杀出二十里，叛军辎重人马损失无数，只有孔有德等千余人安然返回登州，然后立刻将孙元化、兵备道宋光兰、知府吴维城、同知贾杰等人全部放出，下跪认罪，哭泣着恳请得到朝廷招抚，若要定罪，剐他孔有德一人即可！
但晚了
叛军精锐尽失，丧失了全部谈判筹码，就算将孙元化等官员释放，也无法改变东江叛军的命运
崇祯五年正月初二，上万人的朝廷官军杀到，将叛军驻守的登州城团团围困，劝降失败后立刻攻打
正月初五，上百门的大将军炮运到，官军利用这些原本是叛军所操控的火炮，对登州城发起猛轰，不过半日功夫，登州城门就被轰的摇摇欲坠，缺口无数
正月初六寅时（早上四点），一片万胜的欢呼中，登州城门从内洞开，宣告城破，残余叛军只得退守北边的水城，而这里也是海船停靠的港口，只要守住了水城，就有希望通过船只渡海北逃，或逃亡他乡，或投靠后金，总归还有一条退路
但正月初七晚上，站在水城高处的门楼里，眼底映照着港口内的通天火光
望着那一艘艘在大火中燃烧的海船，孔有德心中最后一丝的希望破灭了
没错，在零下三十多度的天气里，海面是结了层厚厚的冰的，不仅海船无法出港，通过冰面，携带着引火物的精锐许家军，也很容易就渗透进了海港，再每三五人对付一艘，很快把上百艘的海船，全部烧的干干净净，残余叛军不可能坚持到三四月份，等海面的冰化了再渡海逃走
最后一根救命稻草失去
朝廷官军则趁机发动最后的劝降攻势
“别再反抗了，我们是仁义之师，除了朝廷点名要拿的贼首，绝不会杀死一个俘虏！”
“东江军兄弟们，你们没有后路可走了，降了吧！我们不会杀人，一个都不杀，还会给你们安排一份很好的工作，家人也可得到妥善安置，再不必过打打杀杀的日子”
“只要投降，尔等罪行皆可赦免，都有活路可走，不要一条道走到黑！”
“你们不就是想活命，想做回普普通通的百姓么？这个机会现在给你们，听说你们的都元帅孔有德就是辽东矿工出身，若是孔有德愿意回到矿上工作，我们不是不能给他这个机会！”
“……”
东江叛军的末日到了，外面一片的劝降声中，越来越多的叛军放下武器，停止反抗，也有的横刀自尽，或跳下城墙自杀
孔有德的末日也到了，他回到住所，先命令妻妾自尽，