湖广独立一师，组建三个步兵师，并由长江水军编成一个支援运输船队加入作战序列全军共有兵员两万六千余，以七军副都统祁斌为都统
同时在鄂州建立后勤补给基地，由湖广置司负责筹集调拨物资，支援对川蜀作战，而朝廷则通过减免税赋和调拨资金予以支持，不增加湖广百姓的负担各军在接到命令后务必于五月达到鄂州集结，整编后即刻投入训练由于当下已经涨水，溯流而上行舟困难，因而暂定在九月出兵，那时上游雨季结束，水流减缓，但水深可行大船
一连十数日，赵昺接连签署数道命令，调集部队出征这天他忙乎完公务，天已经黑下来，他出了门却闻到一股臭味起初他还以为是哪个不长眼的猫狗在周围拉野屎，可小黄门们寻了一圈也没找到，可赵昺走到湖边臭味更浓，这才意识到宫中弥漫的臭气是来自于湖水
赵昺有些纳闷，北宫后苑的小西湖中的水源自城外的西湖，通过水道引导这里的，并非是一潭死水，且去年大修时才刚刚清理过的湖底淤泥，湖水怎么就臭了呢？带着疑问第二天，他亲自乘着小舟在湖中转了一圈，没有发现有大量的死鱼死虾和能够发出臭气的水生植物，这也就表明臭气不是自产的，而是由源头带来的虽然这臭气不至于熏死人，可自己堂堂一个皇帝整日守着一潭臭水过日子，怎么也不舒服啊！
于是赵昺急令临安知府蔡完义进宫觐见，一问之下才知事情大了由于前期临安陷于敌手，疏于管理，导致城中水道淤塞，水质恶化，民众屋舍侵占河道，加上沿河居民多将粪土瓦砾抛扬河内，也会导致城区水道壅塞，水流不畅，两岸居民节次跨河造棚，污秽窒塞，如沟渠然，水无所泄，气息蒸熏，过者掩鼻”，成了臭气熏天的臭水沟使得情况更加严重
收复临安后，虽然加强了管理，并进行了疏浚，但仍有人家偷偷将污水排进河道中且还都后，大批官员和军队的入驻，人口暴增，也是导致河道污染的原因之一此外，在蒙元占领期间，许多人趁乱买了湖边地，甚至是巧取豪夺，他们临湖建设园舍，种植菱藕，倒入粪便垃圾，西湖胜境也面临水污染的威胁
赵昺听了大惊，西湖不仅是杭州城的观光胜地，也是全城人的水源地且朝廷还在湖中设有酒厂，用湖水酿酒，且这酒还是供给皇家祭祀之用的，想想拿着臭水酿的酒给祖宗喝就已经够恶心的了，更不要说自己喝的酒也是产自其中而他知道水源被污染，最容易引发瘟疫，要是在人口如此密集的地方爆发，死的那就是以万计了，而非十个八个的了因此治理水污染已经是迫在眉睫的事情，绝不能再任由情况发展下去……y7