诽”、秦始皇“焚书坑儒”、汉代“党锢之祸”导致灭亡的历史，告诫南京的国民党当局引以为戒
“在这国难时期，们欲图抵抗，这也没有，那也没有，其所以没有的最大原因，就是人才缺乏培植人才，不是容易的事，原有的就嫌不够，还要求多起来，哪能再去随便捕杀、随便摧残呢？”
蔡元培并不仅仅是站在道义和人权的立场上，而是从一个思想家的思维来考量在看来，只有给人民以自由和权利，们才会更加自觉的保家守土，为国奉献反之，收紧人民的自由，不敢让人民有权利当家做主，这样的作法则是短视和愚蠢的，这将使人民对国家的义务感大大削弱，从而从根本上削弱建设国家和保卫国家的动能，与“救亡图存”的旨趣完全违背
当游历西方列强时，感到，正是这些先进国家对民权的重视，使得这些国家的民众对自己的国家和民族有更强烈的责任感、义务感换而言之，蔡元培始终是一个民族主义者，为了国家的强大，有一种强烈的意愿要振兴中国的民权事业，而不仅仅是基于执政者的利益而维护国家的稳定，要以保民权来促进民族的凝聚力、振兴国家，而绝不仅仅是从道义的立场这就是在思想深层面的逻辑
从此，积极地为国民党治下的中国民权事业奔走鼓呼，成了十分重要活动
1933年1月，江苏镇江《江声日报》编辑刘煜生，被国民党江苏省政府主席顾祝同以违背《出版法》名下令拘押，后又依据所谓《危害民国紧急治罪法》将枪杀不久又传出《时事新报》驻京记者王慰三被枪杀，新闻界人人自危
2月1日，蔡元培在华安大厦召开民权保障同盟新闻发布会，发表宣言谴责“此种蹂躏人权、破坏法纪之黑暗暴行，已明白证明顾祝同为实质上与北洋军阀毫无二式、亦即为全国人民之公敌”要求国民党政府即将顾祝同免职惩办，并务使以后不再发生同类事件
这年3、4月间，蔡元培为营救被国民党政权逮捕的罗登贤、廖承志、陈赓等人积极奔走
5月14日，著名女作家、“左翼作家联盟”党团书记丁玲及哲学家、文委书记潘梓年在上海丁玲寓所被国民党特务绑架，并被押往南京
23日，由蔡元培领衔，与杨杏佛、邹韬奋、林语堂等38人联名致电国民党政府：“比闻著作家丁玲、潘梓年，突被上海市公安局逮捕虽真相未明，然丁、潘二人，在著作界素著声望，于国文化事业，不无微劳元培等谊切同文，敢为呼吁，尚恳揆法衡情，量予释放，或移交法院，从宽处理，亦国家怀远佑文之德了”
这年5月，为了抗议德国希特勒的法西斯暴行，蔡元培与鲁迅、杨杏佛等一道在宋庆龄的率领下前往德国驻沪领事馆