支持天主教的传教
为他们提供一切便利甚至他的大军打倒哪里，就让天主教传播到哪里
在历史上，永禄12年，
“第一次信长包围网”成形后，织田信长与京都公家的关系日渐暧昧，织田信长之后与净土真宗的石山本愿寺兵戎相见
支持耶稣会传教便意味着打击佛教势力、同时也能处理好与西南吉利支丹大名的关系、保障与南蛮的贸易
根据松田毅考证，1569—1582这14年间，信长在京都会见耶稣会士15次
在安土城12次加上其他总计31次，两者的同盟关系可谓贯穿始终
可惜，信长之野望，在嫡系铁杆叛变后，戛然而止天正10年，
“本能寺之变”爆发，织田信长的重要部下明智光秀，在京都的本能寺中起兵谋反，杀害其主君信长
本能寺之变中织田信长死难，导致信长
“天下布武”之路戛然而止天主教失去了实力最强的支持者这一次政变，改变了日本的历史进程，亦改变了基督教在日本的命运
如果织田信长成功，他将建立织田幕府那么天主教将成为日本的重要宗教
可惜，耶稣会一百多年的发展和苦心谋划，最终随着织田信长的死去，而化为泡影
而丰臣秀吉在战国时代，对耶稣会也是极尽拉拢之能毕竟，谁都知道，只有不择手段的壮大自己，才是乱世的生存之道
但等到丰臣秀吉统一了东瀛之后，他从支持者，几乎在一夜之间变成了迫害者
天正14年6月19日，秀吉颁《伴天连追放令》，宣布驱逐传教士
但是，他顾忌影响海外贸易，实际上法令并没有彻底落实英国学者贝利指出，《令》颁布后，10余名传教士依然滞留在长崎并担任葡萄牙商船长崎贸易的向导，130余名耶稣会士仍在九州布教，教徒数量仍在迅勐增加，而以西班牙方济各修道会为代表的其他势力也开始进入日本
但是，秀吉的动机，深深的影响了德川家康德川家康统一日本后，对秀吉宗教和贸易分离的政策，深以为然
他禁止天主教，为的是防止关西信教诸侯，勾结海外势力作乱，也为了限制他们通过外贸壮大自己的实力
从这时候开始，幕府对教徒的迫害逐步开始加剧庆长2年，秀吉下令把日本信徒及方济各会修道士总计26人在长崎钉死在十字架上，次年，丰臣秀吉病死在伏见城
庆长18年，在家康已经明令禁止家臣信教的情况下，大名有马晴信的宗教信仰败露，旋即被剥领流放
随即被迫让家臣杀死庆长19年1月，退居幕后的德川家康授意二代将军德川秀忠，组织起草了新的《伴天连追放令》，即
“庆长禁教令”宣布驱逐日本所有传教士，其中包括89名耶稣会士、4名方济各会修道士、2名多明我会