然而正如千子的血肉异变一样，没有任何力量是毫无代价的，
第二军团的超凡力量，很大一部分其实来自于原体对于灵能寄生体的秘密研究，尽管他已经试图抹去这些寄生物的自我意识。
但他没有料到的是，这些看似弱小的寄生物实际上是有“信仰”的。
这些灵能异形很早便成为的混沌的信徒，然而因为对亚空间的有限认识，导致原体并不能从一开始觉察到混沌的存在和本质。
当灵能寄生物被大范围使用有没多久，可怕的变异爆发了。
第二军团的战士从肢体和精神上都出现了剧烈的改变，那种改变如果放在大叛乱之后，一定会被认为是混沌污染，然而当时只是被认为是基因层面的突变。
第二军团的原体试图拯救他的军团，但一切努力都毫无作用，变异的军团战士变得极具攻击性且性格完全扭曲，制造了巨大的祸端。
无奈之下，第二军团的原体只能试图用自己的精神力量消除变异战士的威胁，但他的精神过于涉入那黑暗的领域。
具体发生了什么，赛德修士也无从得知。
但十一军团接到了命令，与其他军团一起，前往第二军团的母星执行“处决”。
这是一个残酷的命令，谁也不知道第二军团究竟发生了什么，但赛德修士告诉索什扬，那是他一生中经历的最残酷的战斗。
堕入黑暗中的第二军团变成了可怕而恐怖的力量，即便面对数个军团的围攻依旧不落下风。
战前，赛德修士只是原体的侍从之一。
战后，他便成为的一连长——因为整个一连几乎在登陆作战中全军覆灭，包括连长在内所有指挥官全部战死。
围攻整整持续了三个月，最终以十一军团原体和第一军团原体莱昂共同将堕落的第二军团原体斩首而告终。
这场残酷的兄弟相残中，按照赛德修士的说法，十一军团损失超过四万名战士，第一军团也大概是这个数，加上其他军团的损失，帝国有十几万战士血洒疆场。
也是因为这一战，十一军团元气大伤，在之后的大远征中不得不偃旗息鼓。
战争结束后，绝大部分第二军团的战士被歼灭，只有极少数没有变异的幸存者，他们原本也该被处决。
但帝皇突然下令宽恕这些战士，之后抹去他们的记忆将他们秘密编入第七和第十三军团中，十一军团也收留了极少数第二军团的战士。
也是在这一惨烈的战争中感受到了亚空间力量的恐怖，第十一军团的原体萌生的制造反亚空间力量的战士的想法，并在了解帝皇的网道计划后坚定了这一计划并付诸实施。
至于为什么到现在，十一军团的后嗣会和第二军团的后嗣编成一个战团，赛德修士只能用“巧合”来解释了。
从索什扬描述到的，智库馆长萨尔珀冬的变异和