收缴的明军武器一股脑的送达前线的岛屿和据点，不仅武装已经反正的张、海、苏三部，还联络沿海的宗族势力和士绅地主，赠送其武器装备，以备在满清真的进行迁界禁海的时候，让其有实力反抗
而第三阶段则是大规模的迁徙行动，海军和陆战队在海洋岛要塞到潮州府长达三万里的海岸沿线占据了大小岛屿七十多座，囤积帐篷、粮食和其他生活物资，特别是在福建与山东沿海，这两处地域已经基本解除了清军的海上威胁，除了外海囤积物资之外，还向沿海的城镇和村落公布所有据点的位置，供其逃亡
而配合第三阶段的便是大规模的特赦和奖励，尤其针对的是绿营将领和沿海士绅，在飓风计划中，李明勋签署了上万份特赦令，发给沿海数省的士绅，持有特赦令的士绅只要抵达沿海据点，就能保证人员和财产安全，不再追究其在满清占领区所作所为的法律责任，给予其准国民待遇，无论其本人和直系亲属是否曾经在满清朝廷为官、参与满清科举，只要在飓风计划期间抵达据点，便是免去一切罪责，而能率众来投、斩杀鞑官鞑将者，还可以得到奖励，而西蒙斯为了提升这些沿海士绅反抗意志，还开创了‘报销制度’
所谓报销制度就是为在飓风计划中为反抗军提供物资的士绅提供对等的回报，比如松江华亭徐氏，听闻张世华反正之后便上门联络，得闻迁界禁海，其麾下田宅祖祠更是在迁界范围，徐氏家老收拾家中金银细软，退入拓林镇中，其家中所存米粮布匹一时带不走，便是全部交由了拓林镇张世华部，张世华派兵转运，共得米粮一万四千石，布匹丝绸七千匹，还有盐、铁等军用物资，北洋战区派人点验之后，开具报销单据，徐氏家老退去台北之后，持单据向台北战略储备库支用水稻两万石，麻布一万匹，另外货物，以现银两千三百元补足
报销制度能保证士绅可以毫不担心的用家财支持合众国指定的三十余支反抗军，所费家财可以得到全部或部分官方报销，这总比士绅付之一炬或者为满清所用的好
到了永历九年的四月中旬，飓风计划的物资准备和人员配备已经基本到位，这个时候，合众国方面坐等满清朝廷进行迁界禁海，而满清朝廷倒是有些不知所措，在无钱无粮的情况下，能厉行禁海的唯一倚仗就是沿海的兵马，但此时绿营与八旗貌合神离，各省多有大规模反叛的情况下，满清朝廷已经信心不足
五月末，北京的福临终于下定了决心，迁界禁海，首先便是笼络沿海的绿营官兵，为其在内陆安排新的汛地，以免威胁其根本利益，在这基础上，绿营的态度逐渐松动，剑拔弩张的局势缓和，绿营家属成为第一批迁界的百姓，让