程中，还有两艘军舰因为遭遇恶劣天气，最终还是被放弃，爪哇海战之中，大舰队还能投入战斗的船只只剩下了十四艘
唯一让李明勋感觉到庆幸的是，洲际贸易船和战列舰没有一艘沉没，洲际贸易船是因为一直没有承受艰难险重的任务，而战列舰纯粹是因为实力强横，而大部分的战果也与战列舰有关
大战之后，重伤的海军军舰前往文岛港进行维修，部分船只返回了马尼拉和巴达维亚，而缴获的荷兰船只中，大部分就近在苏卡达纳、泗水等盟属港口维修
可以说，爪哇海战决定了未来二十年谁是东方世界的海上霸主，而合众国显然抓住了这一机会，夺得了头把交椅，虽然大舰队损失严重，但逃走的巴达维亚舰队损失更大，哈鲁斯和德约特虽然逃跑方向不同，但是有一个共同认知，那就是合众国海军舰队会在取胜之后前往巴达维亚，所以这二人没有敢返回巴达维亚，德约特带领他的小舰队越过马六甲海峡前往了锡兰，在途中还突袭了槟城港和玻璃港，造成了不小的损失，而哈鲁斯直接前去了香料群岛，但无论哪个港口，都没有巴达维亚的修船能力，且双方交通联络困难，所以即便纸面数据上，荷兰人仍然占据优势，但海军掌握了爪哇海却是事实
虽然在合众国与马打蓝联军登陆西爪哇，发动了围城战后，德约特和哈鲁斯都得到死命令，出战爪哇，但那个时候，合众国已经把战损和缴获的舰船维修好，在绝对实力上也占据了上风
实际上，哈鲁斯和德约特的预料非常准确，在确定了控制战场局面之后，李明勋以鹰舰队为主，重组了一支特混舰队，包含了四艘战列舰和三艘重巡以及没有受损的七艘风帆护卫舰，执行对巴达维亚港口的封锁，这支舰队由李北极率领，于五天之后抵达了巴达维亚，并趁夜用炽热的炮弹炮击了巴达维亚城，用炮弹向巴达维亚的居民宣告，谁才是这片海洋的主宰
李明勋和西蒙斯率领大队舰船返回了文岛港，并用通报船把爪哇海战胜利的消息传遍了合众国所有的行政区和所有的盟友，并且在台北和香港两地举行了两场献俘仪式，彻底宣告海战的胜利
虽然海军陆战队一直在邦加岛和北大年枕戈待旦，但李明勋没有贸然发动登陆作战，那个时候，他还不知道德约特逃往了锡兰，哈鲁斯前去了香料群岛的安汶和班达，在失去敌人踪迹的情况下，李明勋必须做最坏的打算，那即是这些依旧拥有战斗力的船只会进行破交作战，忙碌航道的商船暂且不提，李明勋必须要为跨海登陆的陆战队提供足够的防御，而且此时的风向也不对，在于马打蓝苏丹等几个盟友商议之后，李明勋选择在年底十二月发动对巴达维亚的总攻
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