实际上，‘圣杯’有两个——即‘大圣杯’和‘小圣杯’，‘小圣杯’就是你们在厮杀之后，那最后一对主仆获得的奖品，而‘大圣杯’则是负责从地脉中汲取灵力，用以下一场圣杯战争。
那么，圣杯的工作原理是什么呢？
首先，由‘大圣杯’汲取到足够的魔力后，那一次的圣杯战争就开始了。在此，‘大圣杯’汲取的魔力用以选拔御主，从者的召唤。对，当你们进行从者召唤之时，大圣杯会连接到位于通常时间轴之外的被称为“英灵之座”的场所，探寻出与仪式中所使用到的触媒相对应的英灵。没有触媒的情况下，会随机选出英灵。并为御主刻上对应的三划令咒。
然后你们就开始厮杀，每死去一位从者，这个从者的灵魂和构成其的精纯的魔力则进入‘小圣杯’进行储存。
那么，局势就很明朗了，‘小圣杯’实现你们愿望的原因，是因为那以你们这种作为灵长类高端的从者的灵魂为燃料，从而获得海量的魔力量。
简单地说，圣杯这一本身并没有实现愿望这一功能，它仅仅是提供一个‘交换’功能的工具罢了，毕竟魔术还是要遵从‘等价交换’这一基本的。”
“也就是说，圣杯只能由魔术师来使用吗？”
“没错，毕竟小圣杯是储存魔力的(这对问答出自fsnubw闪闪同学亲情解说)。
那么继续。
圣杯的真正作用是什么呢？
圣杯，除去宗教意义上的那个，这个由爱因兹贝伦家提供制造系统，玛奇里家规划出从者系统并完善出用以约束从者的令咒，而远坂家提供地脉良好的土地，最终完成的物品，它存在的意义是什么呢？
是‘孔’。用储存着的魔力链接现世和根源，制造出那么一个小小的，可以窥视根源的‘孔’。”
“恕我直言，这并非是什么重大的事。”caster美狄亚骄傲的说，身为魔术师的她自然也拥有使用小圣杯的能力。
“关键的来了，”李文书喝了一口酒，“我先说一下原理是为了能让你们更好的理解接下来的事：现在的圣杯是不能用来许愿的。
并非是因为机能的损害，而是因为圣杯被污染了。”
“被污染了？”
“没错，现在的圣杯里面装满了‘恶’，它会最大的扭曲你的愿望，体现为对人类的最大的残忍度。假如你许愿长高20厘米，那么圣杯会杀死所有身高在你的身高减去20厘米后以上