火器的威力，潼川府的守军在城中挖掘了大量的土木工事，只需将霹雳军弹药耗光，这城便能长期坚守，待援军一到战局便能逆转。当然为了防止战事不利，守军也在城外的涪江之上架了浮桥，码头上也留了不少船只。
步兵旅在西门扎下营垒之后，便开始炮击。炮击虽然猛烈也击毁了大量城防设施，但在炸塌了一段城墙之后逐渐稀疏下来，并没有大群的士兵从缺口处蜂拥而入。正如守军所料，此次霹雳军通过陆路进攻潼川府，并没有携带充足的弹药。其虽然配备了数百匹骡马和大量的独轮车，但都是用来拉拽野战火炮，其次是运载粮食、火枪子弹、手雷、地雷、三角钉等刚需物资。城墙虽然被炸开了缺口，蒙军又用迅速用杂物堵住了口子，强行冲锋当然能突入城中，但士兵必然死伤惨重。
进攻潼川府的霹雳军指挥官在等待，因为箭滩渡方向已传来了消息，已方的水军炮船正在溯水而来。果然，五日之后，霹雳军的大批战船便出现在潼川府城外的水面，这让城内的守军乱作一团。崇庆府距离潼川府虽然只有数百里，但水路只能在重庆府交汇，蒙军根本就没有料到霹雳军的水军竟然绕行二千余里出现在潼川府。只是现在已经无路可逃了，北方的绵州已被霹雳军占领；东门方向被战船封锁，浮桥也被摧毁；南方的普州也是风声鹤唳，纽璘率军逃入普州之后，曹二狗正率大军缓缓而来。
由于要兼顾机动性，步兵的野战火炮口径比战船的火炮小了许多，炮弹的重量也轻了不少，威力自然就小了不少。河中火炮战船仅一轮齐射，便让城内的蒙军知道了什么叫山崩地裂，原本以为的坚不可摧的城防也土崩瓦解。几轮齐射之后，东门的城门楼便化了一片废墟。
更让守军绝望的是几轮集火齐射之后，战船并没有停止炮击，而是分批继续往炮击城墙倒塌处，将试图堵住缺口的蒙军炸倒伏尸遍地。以水军船只的运输能力，所携带的弹药数量比步兵多了几个基数。限制其火力输出的，除了发红的炮管外，最大原因还是弹药太昂贵了。
逃又逃不了，打又打不过。半个时辰之后，城内的蒙军投降了。在接管城池肃清蒙军残余势力之后，步兵旅的士兵押着俘虏通过陆路前往绵州城。守城的任务留给了水军旅，准确说是一半的水军战船，另一半战船则护送运输船继续北上绵州。
黄大根已经下令，潼川府及绵州将分别由二师师部旅的特种营和侦察营守卫。虽然每营只有五百人，但加上城中民壮，又有战船的火力支援，城防安全倒是无虞。至于黄大根本人将率二师的主力——两个步兵旅、骑兵旅及师部旅的一个营，往梓潼县方向而去。
梓潼属隆庆府管辖