割爱，放弃了梁思成再三修改的设计方案，选择建造临时的平房校舍，由此也就中断了跟中国营造学社的合作事宜。联大随后去信道谢，并送酬金国币三千元。虽然之后联大没有跟中国营造学社继续合作，但仍聘请梁思成、林徽因二位先生个人为新校舍的工程顾问。
一九三八年九月，联大新校舍第一期工程开工,基本于一九三九年三月完工，包括三十六所临时房舍，均采用简陋的土基墙和木板茅草顶，第二期工程于一九三九年三月开工，包括临时房舍五十所，以及图书馆、医院、食堂及其他房舍。二期工程中，学生宿舍为临时房舍规格，教室、办公室作为普通房舍均在屋顶覆盖进口铅铁皮，涂绿色油漆，而图书馆和医院则是唯一保留砖木结构的瓦房，覆盖青瓦顶，新校舍二期预计一九三九年七月竣工。
一九三九年三月，新校舍第二期工程已经备料开工，最初的工作是平整土地、修建围墙、打洋井。自新校舍第一期修建工程开始，联大有许多同学都去新校址看热闹，到第二期工程修建之时，大家早已见怪不怪，加之第二期工程平土时挖出很多墓碑，渐渐就生出许多闹鬼的传言来，去的人就越来越少了。
眼看着新校舍的建造逐渐步入了正轨，联大校长梅贻琦先生的心情却十分复杂。他心里微微松了一口气，想着若是新校舍能如期完工，联大校舍的压力将大大缓解，同时他却始终对梁思成、林徽因二位先生心怀歉疚。梅贻琦先生偶然间听闻二位先生准备搬到乡下去住的消息，得知他们要跟随中国营造学社把家搬到昆明东北郊距离昆明八公里的龙泉镇，便决定在他们搬家前去“止园”探望两人。
梁思成、林徽因夫妇于一九三八年一月辗转到达昆明，二人住在城南巡津街九号的“止园”，户主是一位姓黄的空军军官，梁、林一家共使用这处住宅的三个房间。初到昆明，虽然二位先生表示愿意义务替政府或其他公共机关效力，可他们并不能接到太多建筑设计的工作，偶有帮昆明当地人设计私人住宅的请托，可往往所得颇为微薄。为了应对昆明高昂的房租，林徽因被迫重新开始了教书生涯，一星期爬四次山坡，从城南走到城北，到云大去教六点钟的补习英文，去赚取四十元的课时费。.
其时昆明重要的市政工程建设主要垄断在少数的知名建筑公司和建筑事务所手中，而当时的建筑公司与营造厂则多达六十七家，可见竞争是多么激烈！在这种局面下，当四五月间梁思成和林徽因二位先生先后收到云南大学女生宿舍和西南联大新校舍的设计委托时，