道：“现在，烧吧”
万历十五年六月的最后一天深夜，明军与城内的军情局探子里应外合，用炸药炸开了马尼拉城北边城门，精锐军、探险者和帕西河北岸的汉人青壮一拥而入，将此城攻破
不出钟彦文所料，城内驻扎的土著军队见明军打了个西班牙军措手不及，早有反水之意的他们立即满城暴动，大肆屠杀平日里欺压其同族的西班牙殖民者——因此史上又称此次战争为马尼拉大暴动
在后世西班牙的历史记载中，万历十五年的六月三十日被称为马尼拉浩劫圣地亚哥总督以下，西班牙人不分良贱，近乎被屠杀殆尽其中一篇文献是这样记录的：
“赛里斯人用虚假的和平假象迷惑了圣地亚哥他一心一意的与钦差大臣就‘谢罪文书’字眼字斟句酌，想在不给费利佩二世造成巨大困惑的情形下，解除舰队对马尼拉的封锁”
“但赛里斯人在紧锣密鼓的准备他们秘密的发出征召令，将所有能够使用火枪的探险者都召集起来，并在帕西河北岸进行了广泛的动员”
“有马尼拉浩劫的幸存者作证说，赛里斯钦差许诺，只要攻破马尼拉，城内的所有财富钦差分文不取，全部赠予攻破此城的人于是，本就极度嫉妒西班牙人富有的人都被贪婪主宰了，他们完全忘记了西班牙人给当地带来的文明和足以令他们富足的贸易”
“也有证据显示，当时恰巧一些来自满剌加的贸易商到马尼拉补给，这些贸易商也不光彩的参与了此次掠夺西班牙在马尼拉王城的所有工艺品、艺术品和金银都被他们以极低的价格收购，并带回赛里斯贩卖，这些带血的财富曾经使得整个赛里斯南方陷入了狂喜”
“我们不得不说，整个马尼拉浩劫是赛里斯人在获得他们巨大版图的过程中，最最不光彩的一页无论现在的赛里斯人如何美化他们的历史，此次因为莫名其妙原因引发的战争，都充斥着阴谋和欺骗，屠杀和暴行.”
“有证据表明，赛里斯人开始时并无意进攻马尼拉，因为他们明显没有做好攻城的准备——各种意义上的准备但为什么圣约翰号会如同赛里斯人所说，向他们主动发起进攻，已成为最难解的谜题.”
“.但真正的屠杀来自于土著军队这些乌合之众虽然没有战斗力，但面对王城内的平民却凶残无比他们趁着赛里斯人进攻总督府的时候，分头在各个街区进行抢劫、屠杀和强奸.”
“后来在整个欧洲享有大名的布兰卡.埃尔南多.科隆和她的家庭教师在此次浩劫中，幸赖一位善良的土著仆役的保护，方得以幸存.”
“截至目前，她的回忆录仍然是有关马尼拉浩劫的最有力、最直接的证据笔者在此摘录一段：‘土著士兵见人就杀，不分年龄——只要他是白种人在我